妙玉與賈寶玉的關系較為復雜和微妙。他們是互為知己、同道之交。兩人都是不入世俗的“畸人”,有著相似的性情和觀念。
妙玉將賈寶玉認作“同志”,符合她的基本要求,無分男女之嫌。在“櫳翠庵品茶”一節中,妙玉用自己常日吃茶的綠玉斗給賈寶玉斟茶,這個“仍”字表明賈寶玉并非第一次用此杯,足見兩人關系親近。此外,賈寶玉“冒雪乞梅”時反應“樂為”,也暗示著他們關系非同一般。
有人認為他們之間無情,只是相互欣賞,互為知己;也有人說兩人有情,但受到各種因素制約,這份情愫若有若無。但起碼在妙玉眼中,她與賈寶玉的關系坦然,無男女之情,而是同道之交。